Investigadores del MIT han desarrollado un método que les permite analizar las interacciones tridimensionales de secciones del genoma con un detalle sin precedentes. La técnica podría permitir a los científicos investigar el origen y la progresión de enfermedades genéticas, así como identificar nuevas dianas terapéuticas para ellas. El nuevo enfoque, llamado Region Capture Micro-C, implica el uso de una enzima para cortar una sección del genoma en fragmentos pequeños y uniformes, y luego unir nuevamente partes del genoma que se predice que interactuarán entre sí en el núcleo celular. antes de finalmente secuenciar las hebras para conocer su identidad. Los mapas resultantes que crean los investigadores pueden revelar una gran cantidad de información previamente desconocida sobre cómo los segmentos del genoma interactúan entre sí para controlar la expresión genética.
La expresión genética es compleja e involucra áreas del genoma que pueden regular la actividad de los genes, como áreas llamadas promotores que ayudan a motivar la expresión genética. Si bien algunas de estas regiones se encuentran justo al lado del gen que afectan, otras se encuentran muy lejos, lo que requiere que el genoma se contorsione en el espacio 3D para unir regiones dispares y permitir un control preciso de la expresión genética.
Hasta la fecha, ha sido demasiado complicado y costoso desentrañar todas estas interacciones y comprender completamente cómo funcionan y cómo pueden afectar las enfermedades genéticas. Sin embargo, apreciar los matices de las interacciones genómicas podría arrojar luz sobre este tipo de enfermedades y permitir a los investigadores desarrollar nuevos tratamientos.
"Los investigadores ahora pueden estudiar de manera asequible las interacciones entre los genes y sus reguladores, abriendo un mundo de posibilidades no sólo para nosotros sino también para docenas de laboratorios que ya han expresado interés en nuestro método", dijo Viraat Goel, investigador involucrado en el estudio. "Estamos entusiasmados de ofrecer a la comunidad investigadora una herramienta que les ayude a desentrañar los mecanismos que impulsan la regulación genética".
El nuevo enfoque implica centrarse en un área objetivo del genoma, en lugar de todo, lo que ayuda a reducir drásticamente los costos y el tiempo asociados con el análisis, pero aún genera datos muy detallados. “Ahora tenemos un método para obtener mapas de la estructura del genoma en 3D de resolución ultra alta de una manera muy asequible. Anteriormente, era muy inaccesible financieramente porque se necesitarían millones, si no miles de millones de dólares, para obtener alta resolución”, dijo Anders Sejr Hansen, otro investigador involucrado en el estudio. "La única limitación es que no se puede obtener el genoma completo, por lo que es necesario saber aproximadamente en qué región está interesado, pero se puede obtener una resolución muy alta a un precio muy asequible".
Vea un vídeo del MIT sobre la tecnología:
Estudio en la revista Nature Genetics : Region Capture Micro-C revela la coalescencia de potenciadores y promotores en microcompartimentos anidados
Vía: MIT